JPEG・PNGのシーケンスファイルに変換した動画に、キーフレームとなる１枚を選んでPhotoshopでペイントを行い、このソフトに読み込ませると自動でトラッキングされて、アニメー ション作品になります。
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After Effectsでマスクとなるファイルを作成して利用できます。
下図の失敗例では、
背景を付けたままペイントしたため、ペイントのはみ出した箇所が、背景の色と認識されています。
マスク作成と、キーフレームに最後のフレームを選択しておくべきでした。
映像にペイントの効果を加えるAfter Effectsのプラグインには、RE:Vision社のVideo Goghがあります。