AEで.MFXの動画ファイルを使用するとたまに映像抜けする問題について

AEで.MFXの映像データを編集していたところ、不定期で毎回１フレームのみ真っ黒になります。

ニュアンス的には実際にまばたきをするような感じですごく不定期にパチパチと真っ黒になり、映像が抜けてしまいます。

また、たまにですが、突然別シーンが１フレームのみ表示されたりすることもあります。

.MFXの映像データを編集するのは初めてなのですが、改善方法はあるのでしょうか？

宜しくお願い致します。